因公护照的存放位置可能因机构或单位的不同而有所差异，但通常情况下，因公护照应由以下部门保管：
外事部门：
多数情况下，因公护照由外事办公室或外事部门负责保管。
行政部门：
一些单位可能由行政部门中的外事专员负责保管。
出入境中心：
某些学校或机构可能有专门的出入境中心来统一保管因公护照。
国际合作与交流处：
对于教职工等特定人群，可能需上交至国际合作与交流处。
双跨团组：
随双跨团组出访的人员，回国后需将护照交由原护照保管单位。
长期执行公务人员：
对于长期出国的公务人员，护照可能由持照人自己保管，但任务完成后需及时上交。
需要注意的是，因公护照只能用于因公出国申请签证，并且应在回国后按照相关规定上交至保管单位。
