东京海洋大学的专业设置主要包括以下几个领域：
学部学科
海洋科学部（品川校区）
海洋环境学科
海洋生物资源学科
海洋食品科学学科
海洋政策文化学科
海洋工学部（越中岛校区）
海事系统工学科
海洋电子机械工学科
流通情报工学科
研究生院研究科专业设置
海洋技术科学技术研究科
海洋生命科学（水圈生物科学、生物资源学、海洋生物工学）
食品机能保全科学（食品品质设计学、保健食品科学）
海洋环境保全学（海洋生物学、水圈环境化学、环境系统科学、环境系统工学、国际环境文化学）
海洋管理政策学（海洋政策学、海洋利用管理学）
海洋系统工学（环境技术学、动力系统工学、海洋机械工学、海洋人工智能、海洋探查·利用工学）
食品流通安全管理
以上信息提供了东京海洋大学在本科和研究生阶段的专业设置概览。
