波士顿市区拥有众多知名大学，以下是其中一些主要的大学：
哈佛大学（Harvard University）
麻省理工学院（Massachusetts Institute of Technology, MIT）
塔夫茨大学（Tufts University）
布兰迪斯大学（Brandeis University）
波士顿学院（Boston College）
波士顿大学（Boston University, BU）
东北大学（Northeastern University）
惠洛克学院（Wellesley College）
西蒙斯学院（Simmons College）
马萨诸塞药学院（Massachusetts College of Pharmacy and Health Sciences）
温沃斯理工学院（Winslow Technical Institute）
萨福克大学（Suffolk University）
新英格兰法学院（New England School of Law）
埃默森学院（Emerson College）
伯克利音乐学院（Berklee College of Music）
这些大学在各自的领域都有很高的声誉和影响力，为波士顿乃至整个美国的教育和科研做出了巨大贡献。波士顿市区的高等教育资源丰富，吸引了来自世界各地的学生和学者。
